Lo preguntáis bastante, así que lo mejor es verse este vídeo para darse cuenta de que programar un script de C# en unity no supone ninguna dificultad. De hecho, facilita bastante las cosas.https://unity3d.com/pt/learn/tutorials/modules/beginner/scripting/c-sharp-vs-javascript-syntaxMás ayudas:http://answers.unity3d.com/questions/12911/what-are-the-syntax-differences-in-c-and-javascrip.html Moraleja: Perdedle el miedo a programar en C# , si queréis aprovechar todo el potencial que ofrece Unity, en especial los CustomEditor.

y cosas interesantes comola reflexion  

Concuerdo contigo.Hace unos días me pase a c#,tiene un gran potencial y es mas ordenado que JS.

desde que inicie con Unity me ha gustado y he aprendido mas con C#, aparte JS muy poco he aprendido y no le he colocado empeño a este Lenguaje... lo que he aprendido de JS es gracias a que muchas veces buscando solucion a Scripts hay muchas personas que programan solo en JS y para los que programamos en C# nos toca colocarnos a convertir un JS a C#... pero es de mi preferencia el C#.Saludos (y)