Buscando patrones di con esta publicación  https://www.toptal.com/unity-unity3d/unity-with-mvc-how-to-level-up-your-game-development (en ingles).
 
El autor explica de forma general el uso de MVC en unity3d, me parece una buena implementación.
 
Que les parece a ustedes?

Un clásico el patrón MVC. Unity no ayuda mucho a aplicarlo por su propia estructura de componentes y aquí es donde entran los conocimientos y la experiencia del coder.

Nunca se me había ocurrido aplicar MVC en un proyecto de Unity pero leyendo el artículo creo que puede llegar a ser práctico. En el proyecto actual ya no puedo, ahí tengo un zafarrancho de la ostia  pero cuando empiece uno nuevo contemplaré esta posibilidad