Como puedo animar un modelo guardado en Obj.?...... lo intente con FBX pero se me distorsiona... y no me refiero a que el Weight este mal, sino a que el modelo sale completamente distorsionado.... pero si lo guardo en Obj. no me causa problemas.... por eso necesito saber como animar un Obj........

Antes de poder animarlo, necesitas riggearlo, es decir, crearle un sistema de huesos y vincular los vértices del modelo con cada hueso. Eso debes hacerlo con programas de modelado, por ejemplo, 3ds max, Blender o Milkshape.

Dependiendo del programa que uses, pues tendrás los botones aquí o allá, pero al final todo se trata de lo mismo.

Buscando por internet, también aparecen algunos plugins que hacen un rigging automático, pero en fin, imagino que ya dependerá de cada uno si quiere usarlos o no.

Cuando ya tengas el modelo riggeado, podrás crearle animaciones, en el programa de modelado o en Unity (con la ventana animation, Ctrl+6), aunque aconsejo más el programa de modelado, la herramienta de Unity es algo tosca para las animaciones complejas. >.<

Una vez tengas el modelo con la animación, sí tendrás que pasarlo como FBX (el OBJ no guarda el rigging ni las animaciones).