No soy amante de estos tipos de juegos pero lo baje para darte mi opinion:
 Es fluido con unos controles que responden excelente y con un escenario agradable y te hace pasar un buen rato, sigue asi con tus buenos proyectos

Creo que no me entendiste, el codigo en si funcionara, pero en grandes proyectos esto seria un gran error por sobre todo en cuanto a legibilidad.

Si en todas las escenas usas la misma clase deberias usar herencia, o un metodo que te devuelva las preguntas segun la escena, porque se me queman los ojos si veo algo asi xD jaja
Tambien es aconsejable usar xml

Busca info sobre fadeColor

Creo que deberias leer la documentacion antes de escribir codigo.
Principalmente deberias saber que objeto tiene tu script, luego el nombre de tu script en si, y al final lo que quieres hacer dentro las funciones del Componente que accediste.
http://docs.unity3d.com/ScriptReference/GameObject.GetComponent.html
Ademas si no tienes idea de programacion empieza con ello, porque sino vas a tropezar muy segido.
Saludos

Si, con GetComponent accediendo a su funcion SetActive() esto es algo muy basico, lo cual hay mucha informacion sobre el respecto.

Deberias investigar mas sobre el tema antes de  lanzarte a ciegas, en la doc de unity hay informacion sobre el tema, como por ejemplo esto:
http://docs.unity3d.com/ScriptReference/Network-isClient.html

El tema es que estarias perjudicando al autor de dicho asset, no son grandes corporaciones como para que no les afecte su distribucion. Es solo una opinion.

Todo depende del script,  si quieres mostrar mas de una variable puedes...mostarlas concatenando las variables lo cual te los mostrara en un sola linea, modificar el script para que muestre mas de un label, o crear componentes segun variables tengas.

Principalmente haz un debug para saber si el PlayerPref devuelve un valor, luego a tu componente UILabel accede a su variable text y asiganalo conviertendo dicho dato en string, seria algo asi:
GetComponent().text = PlayerPrefs.GetInt("Puntaje").ToString();
No se si es lo que buscas pero reformula la pregunta para saber cual es el problema en si.

Para que quede centrado utiliza uvs map, es simple hacerlo para un cubo.

Suerte con las expectativas

Puedes utilizar layers para ignorar capas o mediante Physics.Ignore(), este ultimo no lo comprobe, saludos!

Tampoco son tantos if's, son 8 combinaciones.

Como cualquier nuevo, tiene que leer la documentacion xD